Suomen Gemmologisen Seuran tarkoituksena on yhteistyössä jalokivi- ja kultasepänalan järjestöjen kanssa olla jalokivistä kiinnostuneiden henkilöiden ja järjestöjen yhdyssiteenä, työskennellä gemmologisen tietouden syventämiseksi, tukea gemmologista tutkimustoimintaa ja huolehtia toimialallaan jäsentensä eduista.
Tarkoituksensa toteuttamiseksi Seura harjoittaa tiedotus-, koulutus- ja julkaisutoimintaa, kehittää ja hankkii gemmologisia tutkimusvälineitä, järjestää kokouksia, kursseja, juhlia, näyttelyitä ja retkiä sekä antaa lausuntoja. Lisäksi seura pyrkii aktiivisesti vaikuttamaan alan kehittämiseen.